Le Plan d'aménagement du territoire de la municipalité de Milna est le document fondamental régissant le territoire communal. Adopté en 2007, il a fait l'objet de plusieurs amendements, le dernier datant de juin 2019. Cet amendement visait à mettre le Plan en conformité avec l'article 201 de la loi sur l'aménagement du territoire, qui impose la réglementation des zones non réglementées et des zones urbanisées faisant l'objet d'une transformation urbaine.
Le processus d'élaboration du premier amendement au plan d'aménagement du territoire de la municipalité de Milna est en cours, et une décision a été prise lors de la séance du conseil municipal du 24 mars 2020.Journal officiel 2/20.), qui sera adopté après l'adoption du troisième amendement au plan spatial du comté de Split-Dalmatie (qui comprendra les propositions et demandes de la municipalité de Milna).